Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms