Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms