Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hdac6Q9Z2V5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac6Q9Z2V5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms