Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms