Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms