Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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