Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms