Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms