Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms