Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccl8Q9Z121 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccl8Q9Z121 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccl8Q9Z121 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms