Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stau1Q9Z108 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms