Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms