Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited4Q9WUL8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited4Q9WUL8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms