Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms