Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms