Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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