Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms