Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp21Q9QZL6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms