Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms