Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms