Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnckQ9QYK9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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