Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd4Q9QY39 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms