Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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