Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms