Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms