Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms