Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Msrb1Q9JLC3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Msrb1Q9JLC3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Msrb1Q9JLC3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Msrb1Q9JLC3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Msrb1Q9JLC3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Msrb1Q9JLC3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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