Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gde1Q9JL56 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms