Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms