Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp4Q9JKV5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms