Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx5Q9JKQ4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms