Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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