Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms