Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rhox9Q9EQM5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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