Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r46Q9EQ45 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r46Q9EQ45 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms