Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx18Q9EPZ6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms