Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms