Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms