Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxp4Q9DBY0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxp4Q9DBY0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms