Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms