Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fundc1Q9DB70 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms