Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms