Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rexo2Q9D8S4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms