Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem54Q9D7S1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem54Q9D7S1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem54Q9D7S1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem54Q9D7S1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem54Q9D7S1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem54Q9D7S1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmem54Q9D7S1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Tmem54Q9D7S1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmem54Q9D7S1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tmem54Q9D7S1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tmem54Q9D7S1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tmem54Q9D7S1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem54Q9D7S1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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