Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc3Q9D6Y1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms