Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc94Q9D6J3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms