Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23bQ9D662 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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