Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms