Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Zcchc13Q9D548 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms