Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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